Centro de Estudos de História e Antropologia (CEHA)

Coordena as actividades de pesquisa e de formação no domínio da História e da Antropologia. O CEHA está neste momento a preparar um projecto de pesquisa sobre a História Geral da Guiné-Bissau.

Centro de Estudos Socioeconómicos (CESE)

Dedica-se à pesquisa macroeconómica, produz e procura pôr à disposição do público em geral documentação e estudos socioeconómicos especializados sobre o país.

Centro de Estudos Ambientais e Tecnologia Apropriada (CEATA)

O CEATA integra uma célula de estudos ambientais e um processamento informático. Colabora com vários ministérios tendo em curso de eventos as iniciativas de investigação nas redes internacionais de informação tecnológica.
O CEATA preparou e seguiu de perto todo o processo de implantação da Reserva de Biosfera no Arquipélago Bolama-Bijagós e neste momento está implicado na gestão da mesma.

Gabinete de Estudos e Projectos (GEP)

Tem por objectivo elaborar e implementar projectos de estudo, identificar, formular, seguir e avaliar projectos e programas de desenvolvimento, realizar sondagens de opinião pública e consultorias.